Új Galaxy szerver a Bioinformatika Tanszéken

Galaxy szerver

A Bioinformatika Tanszék sikeresen pályázott az Általános Orvostudományi Kar elméleti és gyakorlati oktatásának fejlesztését célzó pályázaton 2023-ban. Az elnyert keretből egy új szervert vásároltunk, amely a klinikai bioinformatika kurzus törzsanyagát képező, a bioinformatikai elemzésekhez használt Galaxy applikáció futtatása mellett már a mesterséges intelligencia modellek fejlesztéséhez szükséges NVIDIA grafikus kártyákkal is felszerelésre került. A fejlesztés révén a hallgatók naprakész tudásra és gyakorlati tapasztalatra tehetnek szert az orvosi bioinformatika területén, így még hatékonyabban járulva hozzá az innovációhoz és a kutatáshoz, emellett pedig az OnkoBank minták feldolgozása során kinyert hatalmas mennyiségű adatot is fel tudjuk dolgozni majd az új szerver segítségével.

A szerveren futó Galaxy Projekt egy elemző rendszer, amely jellemzően bioinformatikai adatok komplex kezelését biztosítja grafikus felhasználói felületen (graphical user interface, GUI). A GUI segítségével a felhasználó feltöltheti saját adatait, de elérheti más felhasználók, vagy adattárházak megosztott adatait is. A Galaxy szervereken található eszköztár biztosítja a feladatok megoldására használható szoftvercsomagok legújabb változatainak gyors elérését, azok paraméterezését. A Semmelweis Egyetemen a Bioinformatika Tanszék által működtetett Galaxy elemző rendszer 2020-ban került beállításra és regisztrációt követően szabadon hozzáférhető a galaxy.semmelweis.hu címen.